Echipa lui Adrian Siemieniec a avut ceva probleme în prima repriză, când a deschis scorul repede, dar a fost egalată după puţin mai mult de un sfert de oră. Victoria şi calificarea au fost rezolvate în repriză secundă, în decurs de numai şapte minute şi Jagellonia Bialystok s-a impus cu 3-1. Într-un alt meci, Panathinaikos Atena a obţinut calificarea în minutul 90+5, când Tete a marcat golul victoriei cu islandezii de la Vikingur Reykjavik, iar grecii au mers în optimi cu 3-2 scor general.
În optimi s-au mai calificat, venind din play-off, Betis Sevilla, Borac Banja Luka, Pafos, FC Copenhaga, Jagellonia Bialystok, Celje, Panathinaikos Atena şi Molde.
Betis Sevilla – Gent 0-1 (A. Brown 87);
Olimpija Ljublijana – Borac Banja Luka 0-0;
Pafos – Omonia Nicosia 2-1 (Bruno 28, Silva 65 / S. Jovetic 60);
Heidenheim – FC Copenhaga 1-3 (Leo Scienza 74 / Chiakha 37, Diks 53 penalti, Huescas 114);
Jagellonia Bialystok – TSC Backa Topola 3-1 (Hansen 8, Imaz 70, Radojevic 76 autogol / Lazetic 17);
Apoel Nicosia – Celje 0-2 (Kucys 45+4, Svetlin 51);
Panathinaikos Atena – Vikingur Reykjavik 2-0 (Mladenovic 70, Tete 90+5);
Shamrock Rovers – Molde 0-1, 4-5 la lovituri de departajare.
