Accidentul a avut loc în apropierea localității Palacios de Sanabria, din provincia Zamora, în apropiere de granița cu Portugalia. Vehiculul în care se afla fotbalistul a părăsit șoseaua pe autostrada A-52, în dreptul kilometrului 65, și a luat foc în urma impactului.
În mașină se mai afla și fratele său, André Jota, în vârstă de 26 de ani, și el fotbalist, legitimat la Penafiel, formație din eșalonul secund al fotbalului portughez. Amândoi și-au pierdut viața în urma accidentului.
Autoritățile locale din Zamora au confirmat incidentul printr-un comunicat: „Doi tineri, în vârstă de 28 și 26 de ani, au decedat într-un accident rutier pe A-52. Pompierii au intervenit pentru stingerea incendiului izbucnit la autovehicul, flăcările extinzându-se și la vegetația din zonă. Odihnească-se în pace.”
